Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARFGAP3Q9NP61 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms