Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CYP4F12Q9HCS2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYP4F12Q9HCS2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms