Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms