Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms