Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FYCO1Q9BQS8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms