Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SPOCK3Q9BQ16 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SPOCK3Q9BQ16 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SPOCK3Q9BQ16 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SPOCK3Q9BQ16 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SPOCK3Q9BQ16 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SPOCK3Q9BQ16 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SPOCK3Q9BQ16 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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