Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms