Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PKP4Q99569 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PKP4Q99569 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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