Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOLD1Q96LR9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOLD1Q96LR9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms