Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK5RAP3Q96JB5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms