Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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