Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms