Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNDC1Q96C34 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms