Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RABGGTAQ92696 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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