Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC82Q8N4S0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms