Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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UBE2Q1Q7Z7E8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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UBE2Q1Q7Z7E8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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UBE2Q1Q7Z7E8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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UBE2Q1Q7Z7E8 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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UBE2Q1Q7Z7E8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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UBE2Q1Q7Z7E8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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UBE2Q1Q7Z7E8 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms