Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PRRT2Q7Z6L0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRRT2Q7Z6L0 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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