Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HECW1Q76N89 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HECW1Q76N89 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms