Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC36A4Q6YBV0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC36A4Q6YBV0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.7 ms