Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SUSD1Q6UWL2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SUSD1Q6UWL2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms