Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZBED9Q6R2W3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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