Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC174Q6PII3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms