Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms