Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TMEM225Q6GV28 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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