Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CARMIL2Q6F5E8 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms