Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATL3Q6DD88 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms