Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms