Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL40Q2TBA0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms