Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC18A3Q16572 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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