Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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