Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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SCN9AQ15858 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN9AQ15858 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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