Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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