Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIP4Q15650 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIP4Q15650 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms