Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PUM3Q15397 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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