Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC3Q15034 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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