Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCLAFQ15004 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms