Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SPIDRQ14159 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SPIDRQ14159 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SPIDRQ14159 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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