Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CUL4AQ13619 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4AQ13619 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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