Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NAE1Q13564 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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NAE1Q13564 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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