Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms