Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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ATRQ13535 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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ATRQ13535 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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ATRQ13535 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATRQ13535 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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