Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCGQ13326 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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