Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K1Q13233 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K1Q13233 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K1Q13233 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K1Q13233 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K1Q13233 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP3K1Q13233 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP3K1Q13233 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms