Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRKAA1Q13131 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRKAA1Q13131 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRKAA1Q13131 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PRKAA1Q13131 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PRKAA1Q13131 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PRKAA1Q13131 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKAA1Q13131 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKAA1Q13131 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKAA1Q13131 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKAA1Q13131 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKAA1Q13131 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKAA1Q13131 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKAA1Q13131 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKAA1Q13131 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PRKAA1Q13131 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKAA1Q13131 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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