Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK3Q13003 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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