Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXF1Q12946 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FOXF1Q12946 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXF1Q12946 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FOXF1Q12946 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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