Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC15Q0P6D6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms