Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms