Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFFO1Q0D2I5 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms