Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLFN5Q08AF3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLFN5Q08AF3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms